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6ミスマッチ修復機能欠損を 　DNAは，複製を繰り返すたびに一定の頻度で複製エラー（replication error）を生じる。DNA複製エラーを修復する主な機構として，直接修復，除去修復，複製後修復，ミスマッチ修復などがあり，特に相補的ではない塩基の組み合わせ（DNAミスマッチ）を修復する機構の異常は，大腸がん発生に重要な役割を果たす。ミスマッチ修復には，MLH1，MSH2，MSH6，PMS2，MLH3，MSH3の少なくとも6つの遺伝子が関与することが知られており，MSH2，MSH6，MLH1，PMS2からなる四量体は主に塩基—塩基ミスマッチおよび1塩基ループをもつ挿入・欠失ミスペアを修復し，MSH2，MSH3，MLH1，PMS2（あるいはMLH3）からなる四量体は主に2～4塩基ループをもつ挿入・欠失ミスペアを修復する。DNA複製エラーは，マイクロサテライトと呼ばれるDNAの1～数塩基の繰り返し配列の部分で起こりやすく，ミスマッチ修復機能欠損によりマイクロサテライトの反復回数に異常が生じ，マイクロサテライト不安定性（microsatellite instability：MSI）を引き起こす。腫瘍抑制，細胞増殖，DNA修復やアポトーシスなどに関与する遺伝子がMSIによりフレームシフトを起こすとがん化につながる1。　ミスマッチ修復に関わるMLH1，MSH2，PMS2，MSH6のいずれかに病的バリアントやエピジェネティックな変化が両アレルに起こると正常な機能を有する蛋白の合成が行われず，ミスマッチ修復機能が欠損状態になる。この状態をmismatch repair—deficient（dMMR）と呼ぶ。その結果，DNA複製エラーを修復できず，バリアントとしてゲノムに固定される。特に複数個所のマイクロサテライト領域において，修復できず惹起されたDNA複製エラーによる反復配列回数の変化を検出する検査がMSI検査である。一般にdMMRやmismatch repair—proficient（pMMR）はミスマッチ修復機能の状態を表す用語であり，dMMRはミスマッチ修復機能IHC検査によるMMRの発現消失，またはMSI検査による高頻度マイクロサテライト不安定性（MSI—H）のいずれかを示す一方，pMMRはIHC検査によるMMR発現が陽性の場合や，MSI検査においてマイクロサテライト安定（microsatellite stable：MSS）やMSI—Lowの場合が含まれて表現される。386.1 背景ミスマッチ修復（mismatch repair：MMR）機能欠損の分子機構dMMRとMSIの定義判定するための検査